Pelabuhan Kuji di Prefektur Iwate, Jepun mencatat tsunami setinggi 1.3 meter pada petang 30hb, manakala beberapa kawasan pesisir Jepun juga telah mengesan tsunami pelbagai ketinggian antara 10 sentimeter hingga 60 sentimeter.
Menurut laporan Nippon Hoso Kyokai (NHK), berdasarkan data Agensi Meteorologi pada jam 2:58 petang waktu tempatan, tsunami setinggi 1.3 meter dicatatkan di Pelabuhan Kuji, Prefektur Iwate pada 1:52 petang (12:52 tengah hari waktu Malaysia). Sebelum itu, Pelabuhan Kuji dan Hamanaka Town di Hokkaido merekodkan tsunami setinggi 60 sentimeter.
Pelabuhan Ishinomaki di Prefektur Miyagi, Erimo Town dan bandar Nemuro di Hokkaido, Pelabuhan Tokachi di Hiroo Town, Hokkaido, Pelabuhan Soma di Prefektur Fukushima, Pelabuhan Hachinohe di Prefektur Aomori, serta Pulau Hachijojima di bawah pentadbiran Tokyo turut merekodkan tsunami setinggi 50 sentimeter.
Kawasan yang mencatatkan tsunami setinggi 40 sentimeter termasuk Pelabuhan Tomakomai Timur di Hokkaido, Pelabuhan Onahama di Bandar Iwaki, Fukushima, Pelabuhan Oarai di Prefektur Ibaraki, dan Pelabuhan Sendai di Prefektur Miyagi.
Pelabuhan Yokohama di Prefektur Kanagawa, Bandar Choshi di Prefektur Chiba, Pelabuhan Kashima di Prefektur Ibaraki, Pelabuhan Miyazaki di Prefektur Miyazaki, Bandar Kumano di Prefektur Mie, Pelabuhan Miyako dan Ofunato di Prefektur Iwate, serta Pelabuhan Kushiro di Hokkaido masing-masing mencatatkan tsunami setinggi 30 sentimeter.
Kawasan Harumi di Tokyo, Pelabuhan Chiba di Prefektur Chiba, Pelabuhan Kamaishi di Prefektur Iwate, Bandar Tosashimizu di Prefektur Kochi, beberapa kawasan di Prefektur Miyazaki, serta kawasan Kominato di Pulau Amami juga merekodkan tsunami setinggi 20 sentimeter.
Selain itu, Pelabuhan Yokosuka di Prefektur Kanagawa, Minami Town dan Pelabuhan Komatsushima di Prefektur Tokushima, Bandar Saiki di Prefektur Oita, serta Pelabuhan Gusuku di Bandar Okinawa, Prefektur Okinawa turut mencatatkan tsunami setinggi 10 sentimeter.
Lebih 1.9 juta penduduk Jepun terima arahan pemindahan
Sebaliknya, menurut Agensi Bomba Kementerian Dalam Negeri Jepun, sehingga jam 12:30 tengah hari, Bandar Urakawa di Hokkaido telah mengeluarkan perintah "Keselamatan Kecemasan" dengan tahap amaran tertinggi kepada 4,982 isi rumah, melibatkan seramai 10,463 penduduk, mengarahkan mereka berpindah segera.
Selain itu, kawasan utama di sepanjang pantai Pasifik dari Hokkaido ke Prefektur Okinawa, melibatkan 922,166 isi rumah atau 1,905,596 orang, telah menerima perintah "Arahan Pemindahan" dengan tahap amaran kedua tertinggi, meliputi 21 kawasan dan membabitkan 207 bandar dan pekan.